上海2021年6月10日 /美通社/ -- 2021年6月9日，明碼生物科技宣布其正式啟用NVIDIA Clara Parabricks Pipeline分析軟件用于基因組應(yīng)用，這是NVIDIA首次在中國交付及實(shí)施NVIDIA Clara Parabricks。本次合作是雙方在基因測序領(lǐng)域進(jìn)行開創(chuàng)型技術(shù)工作的一部分。
整套Clara Parabricks Pipeline分析軟件是一種加速計(jì)算框架，支持使用新一代測序 (NGS) 數(shù)據(jù)的人口、癌癥和 RNA 應(yīng)用。Parabricks Pipelines 是建立在 NVIDIA 的 GPU 架構(gòu)之上，支持一系列基因分析工具來處理從測序讀取到變異調(diào)用的NGS數(shù)據(jù)。Parabricks Pipelines 技術(shù)的引入將為明碼生物科技在測序數(shù)據(jù)分析和多組學(xué)數(shù)據(jù)分析等領(lǐng)域帶來顯著的性能提升。
明碼生物科技致力于應(yīng)用基因技術(shù)為科研機(jī)構(gòu)、制藥公司和醫(yī)療機(jī)構(gòu)提供全方位的多組學(xué)研究和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)應(yīng)用的整體解決方案，并助力合作伙伴推動(dòng)疾病發(fā)病機(jī)制的基礎(chǔ)研究、加速藥物研發(fā)和診斷試劑開發(fā)。同時(shí)，明碼生物科技深耕于基因大數(shù)據(jù)領(lǐng)域，曾參與完成了包括GMI在內(nèi)的多個(gè)大型基因組項(xiàng)目。
“在生物信息學(xué)領(lǐng)域，算力和算法決定了我們對基因數(shù)據(jù)的理解能力和可獲得能力。近年來，云計(jì)算、人工智能、5G技術(shù)的快速發(fā)展為基因測序數(shù)據(jù)的存儲、共享、應(yīng)用提供了更大的可能性。”明碼生物科技首席技術(shù)官李源博士表示：“明碼生物科技每日產(chǎn)生大量的基因測序數(shù)據(jù)，使我們極其關(guān)注生物信息學(xué)分析加速的領(lǐng)域，如何準(zhǔn)確、專業(yè)、快速地處理基因大數(shù)據(jù)是明碼生物科技一直追求的課題。”
在基因3.0時(shí)代，基因大數(shù)據(jù)的有效運(yùn)用將為生命科學(xué)領(lǐng)域帶來無限機(jī)遇，但普通實(shí)驗(yàn)室計(jì)算能力已不足以應(yīng)付日益龐大的數(shù)據(jù)分析，GPU計(jì)算技術(shù)的誕生不僅有助于解決數(shù)據(jù)分析瓶頸問題，更為未來包含 AI 和深度學(xué)習(xí)的實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)分析提出了新的方向。NVIDIA 一直很關(guān)注健康和生命科學(xué)領(lǐng)域并積極布局。Parabricks是一個(gè)即用型的GPU加速軟件套件，從整個(gè)轉(zhuǎn)錄組到單細(xì)胞分析都適用于群體基因組學(xué)的DNA種系變異調(diào)用、癌癥基因組學(xué)的DNA體細(xì)胞變異調(diào)用，以及RNA測序項(xiàng)目。Parabricks能夠提供更好的基因組學(xué)見解并加速診斷以改善治療結(jié)果。
明碼生物科技首席信息官費(fèi)家俊先生
明碼生物科技首席信息官費(fèi)家俊先生指出：“基因測序市場規(guī)模的擴(kuò)展和大量的科研工作讓企業(yè)的IT設(shè)施受到了巨大的挑戰(zhàn)。而NVIDIA的出現(xiàn)將一定程度地緩解這些壓力，其GPU計(jì)算技術(shù)將大大加快測序數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)分析時(shí)間，使我們能夠迅速完成客戶的計(jì)算任務(wù)，讓客戶更多地關(guān)注業(yè)務(wù)能力，發(fā)揮數(shù)據(jù)的價(jià)值。我相信，新一代互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)將逐漸滲透到基因行業(yè)之中。”
NVIDIA基因合作伙伴關(guān)系全球總監(jiān)George Vacek博士
NVIDIA基因合作伙伴關(guān)系全球總監(jiān)George Vacek博士表示：“明碼生物科技在基因大數(shù)據(jù)領(lǐng)域深耕多年，我們期待與這家創(chuàng)新公司合作，使用NVIDIA Clara Parabricks Pipelines讓基因組醫(yī)學(xué)和數(shù)據(jù)分析造福主流醫(yī)學(xué)。”
左起：明碼生物科技首席信息官費(fèi)家俊先生，NVIDIA醫(yī)療行業(yè)銷售總監(jiān)趙文雄先生
明碼生物科技與NVIDIA的合作代表著生物技術(shù)和信息技術(shù)的融合發(fā)展，推動(dòng)生命科學(xué)從“實(shí)驗(yàn)驅(qū)動(dòng)”向“數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)”轉(zhuǎn)型發(fā)展。明碼生物科技和NVIDIA 共同努力，通過強(qiáng)大的資源整合，為基因組學(xué)產(chǎn)業(yè)鋪就一條新的IT高速公路，讓未來變得更健康和美好。
